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一般说来，当被分离混合物中易挥发组份增多时，就选用位置较高的进料口。随着分子蒸馏装置中进料状态改变，也应该相应地调整进料口，进料温度降低时，用位置较高的进料口；反之，用位置较低的进料口。
如果说分子蒸馏设备有两个以上进料口的话，一般都需要设置在装置不同的高度上。生产中应根据具体情况，选择适当的进料口，必要时还需进行调整。基本的原则是，对进料温度在泡点或接近泡点时进料的设备，进料口的选择是依据进料的组成与进料板的组成相一致而决定的。
在进行分子蒸馏的过程中，多因素都会影响分子蒸馏设备的作业能力，其中较为明显的就是进料位置和填料种类。正是因为如此，在设计分子蒸馏装置的时候，要谨慎。
当分子蒸馏设备在运用不同种类填料的情况下，分离效果也是不一样的，根据装填方式可分为散装填料和规整填料，与同样尺寸相比，鲍尔环在分子蒸馏装置中的气液通量高，分离效果也好。
蒸馏操作是一项重要的前处理步骤。传统的蒸馏设备，其加热、蒸馏、冷凝、接收部分等各自分工，操作繁琐，效率较低；且由于缺乏蒸馏终点控制，常导致蒸馏失败，影响工作效率，而且明火加热易爆瓶，操作危险。短程分子蒸馏仪的出现让蒸馏操作变得那么的简单。
短程分子蒸馏是一种液－液分离技术，它能在真空下操作，能使液体在远低于其沸点的温度下将其分离。主要由加热、蒸馏、冷却水以及接收装置四部组成，按操作条件可分为常压、减压或高真空蒸馏；利用分子运动平均自由程的原理，将液体混合物稍稍加热，使液体分子从液面逸出，轻分子落在冷凝面而重分子又返回，这样就将液体分离了。
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